"Столкновение цивилизаций" отличается от других игр на развитие цивилизаций тем, что у игроков есть возможность развивать свои цивилизации с нуля. Игра не зря имеет такое название – в ней могут сосуществовать социумы, которые в реальной истории человечества никак не могли столкнуться.

Игровое поле состоит из гексов. Цивилизации начинают развитие и экспансию в разных уголках поля, постепенно открывая близлежащие участки поля. Каждый новый открытый участок приносит ресурсы. Механика игры гарантирует, что игрок не будет полностью лишен возможности победить только из-за того, что открытые им территории оказались неудачными. При помощи новых построек игроки развивают и расширяют свои города. 

Победить можно разными путями, так как победные очки даются за достижения в различных областях развития цивилизации: за культурный уровень общества, за то насколько народ доволен уровнем своей жизни, за развитие и количество городов, а также за выполнение военных и мирных задач.